Ciclo de Conferencias: "Bioinformática y aplicaciones prácticas para el análisis de datos biológicos"

02 de mayo (13:30-13:45 hrs)

Conoce al Nodo Nacional de Bioinformática (NNB-CCG), así como a la Red Mexicana de Bioinformática (RMB). Descubre las diferentes actividades a las que puedes integrarte y formar parte de estas comunidades.

El NNB-CCG es un grupo que une profesionales y académicos para apoyar, proporcionar servicios, y mantener el crecimiento del campo de bioinformática en la investigación. https://www.nnb.unam.mx/

Buscando promover la cooperación global con otras redes y comunidades relacionadas con la bioinformática, en el 2018 apoyó la creación del “Red Mexicana de Bioinformática” (RMB). Dicha Asociación tiene la misión de fomentar el desarrollo y expansión de la cultura bioinformática en el país bajo principios éticos de interacción colectiva organizada, y la visión de llegar a ser un modelo de colaboración en bioinformática a ser emulado por otras redes en México y Latinoamérica.

Dra. Irma Martínez

Estudió la carrera de Química en la Facultad de Química de la UNAM, y la Maestría y Doctorado en Biotecnología en el Instituto de Biotecnología de la UNAM. Se desempeña productivamente en su actual cargo académico. Su proyecto principal es “Búsqueda de receptores para bacteriófagos que infectan a Rhizobium etli“; el cual tiene como objetivo principal determinar que receptor (es) de membrana o superficie de Rhizobium permite (n) la entrada de diferentes fagos, principalmente el fago RHEph01.
También, participa en docencia, en diferentes cursos de posgrado; en la formación de recursos humanos; y brinda apoyo en diferentes ámbitos de las actividades del grupo. Así mismo, se ha involucrado en la organización de actividades académicas sobresalientes del CCG-UNAM como son los “Talleres Internacionales de Bioinformática”, que se han celebrado en varias ocasiones. Actualmente, es la Tesorera de la Red Mexicana de Bioinformática (RMB).

MTI. Shirley Alquicira

Estudió la Ingeniería en Informática y la Maestría en Tecnologías de la Información en la Universidad Politécnica del Estado de Morelos (UPEMOR). Desde 2009, trabaja en el Centro de Ciencias Genómicas (CCG) de la UNAM. Actualmente es Técnico Académico Titular “A” de tiempo completo y recientemente se incorporó a la Unidad de Administración de Tecnologías de Información (UATI) del CCG. Su trabajo ha contribuido a la publicación de varios artículos en revistas internacionales, entre otros productos. En el ámbito académico y de divulgación, ha participado como profesora en distintas asignaturas de la Licenciatura en Ciencias Genómicas y en el Programa de Doctorado en Ciencias Biomédicas de la UNAM, así como en la Facultad de Ciencias de la UAEM. También, forma parte del comité directivo del Nodo Nacional de Bioinformática (NNBCCG), así como del comité organizador de actividades académicas sobresalientes del CCG-UNAM como son los “Talleres Internacionales de Bioinformática”. Es instructora certificada de Software Carpentry, programa enfocado a promover conceptos pedagógicos y buenas prácticas de enseñanza. Es miembro fundador de la Red Mexicana de Bioinformática (RMB) y funge como responsable de la gestión de proyectos de la misma.

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02 de mayo (13:45-14:15 hrs)

Durante una infección provocada por el virus de la diarrea epidémica porcina (PEDv), la presencia de variantes virales intrahuésped, la compartimentación y la coinfección con otros patógenos podrían afectar la virulencia y la respuesta inmune a la infección.

Usando secuenciación de siguiente generación, se analizaron las secuencias virales presentes en muestras tomadas de lechones con diarrea aguda y se exploraron las posibles interacciones entre PEDv y otros patógenos menos reportados, así como el gen codificante de la proteína Spike (S), amplificado directamente de diferentes órganos pertenecientes a animales positivos para investigar la variación intrahuésped del virus.

Dra. Montserrat García

La Dra. Montserrat García es Profesora de Virología en la Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia de la UNAM y es investigadora asociada del proyecto PRONAII “Diversidad Biológica, Socio-Ecosistemas y Enfermedades Virales Emergentes en México” (CONACYT). Realizó sus estudios de Posgrado en la Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia de la UNAM estudiando las interacciones patógeno-hospedero durante infecciones por Coronavirus en cerdos, así como estudios de la cuasiespecies viral usando NGS. Su interés científico se centra en los virus que afectan la salud y producción animal, actualmente su participación en proyectos de investigación se enfoca en virus con potencial zoonótico y Coronavirus.

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03 de mayo (13:30-14:00 hrs)

Desde que la penicilina fue descubierta por Alexander Fleming en 1928 aislada a partir del hongo Penicillinum notatum, los antibióticos han sido fundamentales para el control de enfermedades infecciosas producidas por bacterias patógenas, sin embargo, el uso indiscriminado de estos antibióticos, tanto en la industria veterinaria, como en el área médica, ha dado lugar al desarrollo de resistencia en estas bacterias, resultando un serio problema de salud pública a nivel mundial. Debido a que la aparición de nuevas moléculas antibióticas ha disminuido drásticamente, se tienen que buscar alternativas. Una de esas alternativas es el uso de péptidos con actividad antimicrobiana, estos péptidos son producidos por prácticamente todos los seres vivos y es importante caracterizarlos para determinar su posible uso en infecciones por bacterias multirresistentes. Entre las sustancias que presentan estás moléculas se encuentran los venenos de algunos arácnidos, así como las secreciones de algunos anfibios como las ranas y el veneno de algunas avispas. En este trabajo, se caracterizaron algunas variantes de péptidos obtenidos de secreciones provenientes de ranas, así como de venenos de avispa, con la intención de evaluar su capacidad antimicrobiana.

Dr. Iván Arenas

El Dr. Iván Arenas realizó sus estudios en la licenciatura en biología por la Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad del Estado de Morelos, realizando su tesis sobre la aplicación de la tecnología de phage display para estudiar el mecanismo de acción de las toxinas de Bacillus thuringiensis. Posteriormente, terminó sus estudios de maestría y el doctorado en Ciencias Bioquímicas por el Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional Autónoma de México donde realizó la identificación de un nuevo receptor de la toxina Cry1Ab, así como la identificación de las regiones de interacción importantes para la toxicidad. Más adelante, realizó una estancia postdoctoral en el Centro de Investigaciones en Biotecnología de la Universidad Autónoma del Estado de Morelos. Ha publicado más de 25 artículos internacionales y pertenece al Sistema Nacional de Investigadores nivel I. El dr. Iván es socio numerario de la Sociedad Mexicana de Bioquímica y de la Sociedad Mexicana de Biotecnología e Ingeniería. Finalmente, se incorporó al Instituto de Biotecnología en departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos en el grupo del Dr. Gerardo Corzo trabajando con péptidos antimicrobianos, así como la caracterización de componentes de venenos de arañas y serpientes. Ha impartido cursos tanto en México como en el extranjero y en la actualidad, participa en cursos tanto a nivel licenciatura como a nivel posgrado en el programa de maestría y doctorado en ciencias bioquímicas, así como en el programa de doctorado en ciencias biomédicas.

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04 de mayo (13:30-14:00 hrs)

La curiosidad por conocer los componentes de secreciones venenos de animales, principalmente aquellos que nos hacen daño, ha llevado a convertir componentes nocivos de dichas secreciones en moléculas que nos pueden ayudar y aliviar ante una enfermedad ya sea pasajera o crónica. El análisis de componentes de venenos se realiza hoy en día con infraestructura tal que con solo pocos miligramos de los venenos en cuestión se pueden elucidar estructuras que posteriormente, mediante la biología sintética pueden producirse a mayor escala, y así estudiarlos a más detalle. Una subdisciplina que apoya el estudio de los componentes de secreciones venenos de animales es la informática biológica con la cual la aplicación de tecnologías computacionales, estadística y en sí análisis de datos biológicos llevan a proponer estructuras que pueden llegar a tener un mejor beneficio en la salud humana.

Dr. Gerardo Corzo

El Dr. Corzo realizó sus estudios en Ingeniería en Bioquímica Industrial por la Universidad Autónoma Metropolitana, tiempo en el cual también realizó una estancia de investigación sobre Biotecnología Marina en la ciudad de Tsukuba, Japón. Posteriormente, terminó sus estudios de Maestría en Biotecnología en el Instituto de Investigaciones Biomédicas de la UNAM, y con el apoyo del programa Fullbright-García Robles, culminó sus estudios de doctorado en la Oklahoma State University. Posteriormente viajó a una estancia posdoctoral al “Suntory Institute for Bioorganic Research” en Osaka, Japón, y como investigador asociado. En el 2004 se incorporó al Instituto de Biotecnología de la UNAM, donde actualmente es Investigador Titular “C” de tiempo completo en el Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos.

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