CDSB: Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor

Duración: 32 horas
Nivel: Intermedio-avanzado
Idioma: español
Fecha: del 28 al 31 de octubre de 2024
Horario: lunes a jueves 9:00 – 17:00 (hora del Centro de México)
Modalidad: EN LÍNEA
Información: https://comunidadbioinfo.github.io/es/post/cdsb-2024-workshop/
Página del taller: https://comunidadbioinfo.github.io/cdsb2024

En este taller aprenderás cuáles son los pasos cruciales para desarrollar un paquete de R y algunas buenas prácticas para la generación de código. Con la integración de estas herramientas, tendrás la oportunidad de crear tu primer paquete y contribuir a la comunidad de desarrolladores.

Este curso está dirigido a personas que desean aprender a desarrollar paquetes para utilizando herramientas de R/Bioconductor.

Este taller es de un nivel avanzado, por lo que necesitarás contar con algunos conocimientos previos:

• Conocimientos básicos de RStudio:
  • Creación de Rscripts, manejo de la consola de RStudio, manejo del espacio de visualización.
• Conocimientos intermedios de R:
  • Manejo de variables, lectura de archivos, creación y manejo de data frames y listas.
  • Generación de gráficas.
  • Cómo instalar paquetes desde CRAN y Bioconductor.

Requisitos técnicos:

• Computadora Personal. Un mínimo de 4 GB de RAM, un ratón y espacio de disco suficiente para archivos de texto y archivos de imagen.
• Privilegios de administrador para instalar y ejecutar utilidades de RStudio.
• Tener instalado R y RStudio en su última versión.

* Al inscribirte al taller está bajo tu responsabilidad contar con los conocimientos previos requeridos.

• Día 1: Flujo de trabajo orientado a proyectos
  • Introducción al flujo de trabajo orientado a proyectos.
  • Paths seguros.
  • Buenas prácticas de configuración y mantenimiento de espacios de trabajo.
  • Modificando los archivos de inicio de R.
  • Nuevas funcionalidades de RStudio, Quarto.
• Día 2: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte I
  • Control de versiones con GitHub y RStudio.
  • Solución de problemas con las versiones de paquetes de Rstudio.
  • Infraestructura de un paquete de R/Bioconductor.
  • Plática: Convirtiendo tu flujo de análisis en un paquete de R/Bioconductor.
  • Documentación de funciones.
  • Sesión social: Conociendo a la comunidad.
• Día 3: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte II
  • Diseño de pruebas.
  • Creación de viñetas.
  • Compilación e instalación de paquetes.
  • Proyectos colaborativos Parte I.
• Día 4: Proyectos colaborativos
  • Proyectos colaborativos Parte II.
  • Presentación de proyectos.
  • Clausura.

Este es un curso digital. Las sesiones y material del curso serán presentados en línea. Esta modalidad incluirá grabaciones de video o audio del material, intercambio de archivos y sesiones de discusión temáticos, ejercicios de auto-evaluación y acceso a los instructores para comentarios durante el curso.